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新型冠状病毒变异成两个亚型?不是真的锤子!近年来,这种新型冠状病毒突变是否引起了人们的关注。对于冠状病毒发生了什么样的变异,病毒变异是否影响其致病性和传播,公众有很多疑问。科技日报记者就这些问题咨询了基因组学和病毒学领域的许多学者。病毒变异很常见,“质变”尚未到来病毒变异非常普遍,每一株病毒的序列都或多或少不同。”加州大学圣地亚哥医学中心副教授李克峰说,病毒株之间的差异类似于“成千上万的人和成千上万的脸”。

最近,论文《关于sars-cov-2的起源和持续进化》发现,基因组中一个蛋白编码位点的突变形成了两个“群”,经过100多个新冠状病毒株的全基因组序列比对,被媒体称为“亚型”目前,这种变异程度造成的差异还不足以称之为“亚型”,更适合称之为clade”,有病毒专家称“亚型”有着独特的含义。不同的病毒有不同的定义。不是只有一两个突变能区分“亚型”。相关专家表示,病毒刚刚发生,变化不大。根据目前对该病毒的认识,该病毒的变异率为每年1000个碱基中约1个碱基的变化,只有在关键点的变化才能导致显著的变异。

中国科学院副秘书长、中国科学院院士周琦回答了新冠状病毒变异是否会影响疫苗研发的问题。目前,病毒变异并不影响药物研发、抗体制备和疫苗制备。在病毒变异过程中,需要更多的病例和更深入的研究。目前,研究人员正在积极观察病毒变异程度,安排科研项目。序列共享,要实现真正的大数据挖掘,目前基因序列比对研究的样本量大多在100个左右。李克峰认为,研究样本量太小,无法解释突变发生在武汉的时间和是否。此外,对于冠状病毒样本的数据挖掘,还应注意其代表性。

例如,在本文选取的数据中,武汉市的样本大多在元旦前后,1月底左右的样本大多集中在国外,广东、云南等地1月中旬的样本数据也有少数是零散的,很难讲出病毒复制的“故事”,进化与生成。”数据的严重缺乏可能导致分析结果的片面性。”根据国家生物信息中心(国家基因组科学数据中心)于2019年建立的新冠状病毒信息库发布的统计数据,全球共有283个冠状病毒新序列,其中全基因组序列仅有200个国家科学数据中心负责人。对于数据挖掘的需求来说,这相当于“杯水车薪”。

为了了解病毒的“习性”,我们需要研究与临床资料的相关性。如前文所述,新型冠状病毒可分为S型和L型,前者攻击性更强,后者更温和。李克峰认为:“目前,不能根据病毒的基因序列独立判断病毒的习性。科学家试图探索病毒蛋白与宿主受体的结合程度,以此作为判断病毒传播的依据,但病毒的致病性还没有找到一个共同的规律,即病毒是“凶猛”还是“暴力”,如何推断本文利用序列分析软件对新型冠状病毒的基因差异进行分类,得到各基因类型与患者临床表现的相关性。

我认为这只能是一个推测性的结论,“美国堪萨斯大学医学院教授董亚峰认为,分析患者的临床资料与病毒变异之间的相关性具有现实意义。”寻找基因变异是一项非常重要的工作,但难度很大。在数以万计的患者中,我们发现了突变的基因片段,这相当于大海捞针。我们不能,也不必,对每个病人的基因进行测序来寻找突变。通过选择特殊患者、不同流行病学史或不同地区的患者进行基因测序,我们可以加快寻找突变基因的速度。”董亚峰解释说,比如在一些特殊病人中,核酸检测一直是阴性的,但临床资料如CT图像往往是阳性的;治疗后,通过对这些特殊病人的基因序列分析,核酸转为阴性再转为阳性的病人,与普通患者相比,能更有效地发现基因突变片段。

寻找新冠状病毒的变异,不仅显示了对新冠状病毒的深刻认识,而且具有很大的现实意义。董亚峰举例说,阴性检测试剂盒可能是由于基因片段的某些特定区域发生突变,所以无法检测出来。通过基因突变的发现,我们还可以设计出更好的核酸检测试剂盒;例如,通过对有突变和无突变基因患者的临床资料进行统计分析,可以对基因突变与疾病的发展、康复等指标进行相关性分析,以指导更有效、更准确的治疗。”不同变异病毒的临床症状可能完全不同。

董亚峰强调,科学研究的意义不仅在于发现差异,更在于重视临床应用。本报记者张嘉兴[编辑:田伯群]。。

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